RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 VSIG8P0DPA2 414 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ANXA3P12429 323 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 EDN3P14138 238 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CPN1P15169 458 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TBPP20226 339 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MPZP25189 248 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLC6A9P48067 706 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PLA2G7Q13093 441 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TNK1Q13470 666 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MEF2DQ14814 521 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZMYND11Q15326 602 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 AWAT2Q6E213 333 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RTL6Q6ICC9 239 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MTFR2Q6P444 385 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZS92 163 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR5AS1Q8N127 324 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC18Q8N456 261 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RNF170Q96K19 258 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CHST5Q9GZS9 411 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CST11Q9H112 138 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 EXO5Q9H790 373 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 POLEQ07864 2286 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FBN3Q75N90 2809 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RAB27BO00194 218 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 KDM4BO94953 1096 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CYB5AP00167 134 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CD74P04233 296 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 HCKP08631 526 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 COX5BP10606 129 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLC2A1P11166 492 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GTF2F2P13984 249 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ABOP16442 354 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEA5P43359 124 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MEOX1P50221 254 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FAPQ12884 760 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CDK10Q15131 360 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FCN2Q15485 313 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 BIVMQ86UB2 503 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FJX1Q86VR8 437 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SPICQ8N5J4 248 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ASB13Q8WXK3 278 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SPSB1Q96BD6 273 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 FAM210AQ96ND0 272 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TECTBQ96PL2 329 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GON7Q9BXV9 100 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2QL1A1L167 161 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 DISC1C4P0D8 188 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SSNA1O43805 119 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RAB3DO95716 219 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms