RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF676Q8N7Q3 588 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 THEM6Q8WUY1 208 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 HAS2Q92819 552 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MCHR2Q969V1 340 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TXNDC15Q96J42 360 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 AMELYQ99218 206 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 KCNS3Q9BQ31 491 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 WACQ9BTA9 647 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 EMC6Q9BV81 110 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SRRQ9GZT4 340 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TPK1Q9H3S4 243 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 POLE4Q9NR33 117 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CKLFQ9UBR5 152 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MEMO1Q9Y316 297 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ETV7Q9Y603 341 aa5.69□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 RYR3Q15413 4870 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ACOD1A6NK06 481 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PSMD9O00233 223 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CTDSP2O14595 271 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CXCL13O43927 109 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PEX14O75381 377 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 HLA-DQB1P01920 261 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 QDPRP09417 244 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 H2BFMP0C1H6 154 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 NPR2P20594 1047 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 NR4A2P43354 598 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MAGEA5P43359 124 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 RANBP1P43487 201 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 KIR3DL2P43630 455 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TNFSF10P50591 281 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CAPZA1P52907 286 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CLDN20P56880 219 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CARD18P57730 90 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF79Q15937 498 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TRIM16LQ309B1 348 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF766Q5HY98 468 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CNIH2Q6PI25 160 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FAM131AQ6UXB0 335 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FCRLAQ7L513 359 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 WDFY1Q8IWB7 410 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 TMEM106AQ96A25 262 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 SP140LQ9H930 580 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 RNF122Q9H9V4 155 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ABCB9Q9NP78 766 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 NOX4Q9NPH5 578 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FAM206AQ9NX38 181 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 HHLA2Q9UM44 414 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 DHDHQ9UQ10 334 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 ZNF175Q9Y473 711 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.68□□□□□ -1.5
CCL20-202ENST00000409189 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms