RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCN3BQ9NY72 215 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRRS1LQ9P0K9 344 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGLQ9Y2B2 252 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USF3Q68DE3 2245 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5B21A6NL26 309 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF850A8MQ14 1090 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XPNPEP2O43895 674 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFHR2P36980 270 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR3DL2P43630 455 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETV1P50549 477 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTG1P62324 171 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEACAM21Q3KPI0 293 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM155Q4W5P6 130 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM76BQ5HYJ3 339 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLVS2Q5SYC1 327 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNLSQ5VYX0 342 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC9AQ6UXN8 241 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STX19Q8N4C7 294 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPICQ8N5J4 248 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5A2Q8NGI9 324 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGCQ92535 297 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf159Q96HA4 380 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TECTBQ96PL2 329 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TLNRD1Q9H1K6 362 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9H521 79 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FKBP14Q9NWM8 211 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM212A6NML5 194 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4C45A6NMZ5 311 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD5LO43866 347 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRASP01111 189 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV2-70P01814 119 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAHP16930 419 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNG3P63215 75 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MVKQ03426 396 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF154Q13106 437 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYB5R2Q6BCY4 276 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1M1Q8NGA1 313 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PP6455Q8WZ26 134 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYDGFQ969H8 173 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB39BQ96DA2 213 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COMMD4Q9H0A8 199 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BABAM2Q9NXR7 383 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TREM2Q9NZC2 230 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF7Q9UBF6 113 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HHLA2Q9UM44 414 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A6NLC8 198 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC1A7O00341 560 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERPINA3P01011 423 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRPP07492 148 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MDH2P40926 338 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PMELP40967 661 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R43P59537 309 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPPED2Q15777 294 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNJ8Q15842 424 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AVPI1Q5T686 147 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AHSA2Q719I0 299 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HPSE2Q8WWQ2 592 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF170Q96K19 258 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAL3ST1Q99999 423 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHST5Q9GZS9 411 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UFSP2Q9NUQ7 469 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS13CQ709C8 3753 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIAL4EA0A075B759 164 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISPDA4D126 451 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP5LA4QPB2 252 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD61A6NGH8 418 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIAL4DF5H284 164 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LY6G6DO95868 133 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK1P06493 297 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIAL4FP0DN26 164 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMO4P61968 165 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP1-1Q07627 177 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMYND11Q15326 602 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ODF4Q2M2E3 257 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCXD3Q63HM9 321 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR86Q86TI4 376 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5AK2Q8NH90 309 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS4Y2Q8TD47 263 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDCA4Q9BXL8 241 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms