RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 KRT8P05787 483 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF12P17014 697 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CPT2P23786 658 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CAPGP40121 348 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CSNK2BP67870 215 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 IL5RAQ01344 420 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RAB40BQ12829 278 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF154Q13106 437 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MPPED2Q15777 294 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAM201AQ5SY85 155 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 USP43Q70EL4 1123 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAM57BQ71RH2 274 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KLBQ86Z14 1044 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NANPQ8TBE9 248 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 REEP6Q96HR9 211 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR8B2Q96RD0 313 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A7Q99884 636 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MRI1Q9BV20 369 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ADI1Q9BV57 179 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM165Q9HC07 324 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ABCB9Q9NP78 766 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RNF7Q9UBF6 113 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MIOXQ9UGB7 285 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 VWFP04275 2813 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 A6NHS1 94 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 A6NLC8 198 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ENTPD6O75354 484 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 WNT2P09544 360 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1B1P15313 513 aa6.4□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 HILS1P60008 231 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GNB2P62879 340 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAM3AP98173 230 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF691Q5VV52 312 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 SPERTQ8NA61 448 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR8S1Q8NH09 359 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NRG4Q8WWG1 115 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SGK3Q96BR1 496 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RNFT2Q96EX2 444 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PGAM5Q96HS1 289 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR8B4Q96RC9 309 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 Q9H521 79 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 BRD7Q9NPI1 651 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.4□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LRP12Q9Y561 859 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 AUP1Q9Y679 476 aa6.4□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0U1RQV5 110 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DAPL1A0PJW8 107 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 METTL15A6NJ78 407 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 M0R129 80 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS8O00214 317 aa6.39□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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