RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HEATR5AQ86XA9 2040 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf105B2RV13 164 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OGG1O15527 345 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 IGHA2P01877 340 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LIPFP07098 398 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SFTA3P0C7M3 94 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CRISP2P16562 243 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PCMT1P22061 227 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MMP16P51512 607 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 IRF3Q14653 427 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A6Q4U2R8 563 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CST9LP1Q5W188 147 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR2T2Q6IF00 324 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB119Q8N690 84 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF480Q8WV37 535 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OCEL1Q9H607 264 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RHCGQ9UBD6 479 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 AKR7A2O43488 359 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SFT2D2O95562 160 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TBXA2RP21731 343 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SLC37A1P57057 533 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NHLH1Q02575 133 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 AKR1C1Q04828 323 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf61Q13536 156 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SYPL1Q16563 259 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HIST3H3Q16695 136 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 REC114Q7Z4M0 266 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SCAMP4Q969E2 229 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CRB3Q9BUF7 120 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 C20orf27Q9GZN8 174 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 IGSF23A1L1A6 192 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CCL22O00626 93 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HPP00738 406 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TYMSP04818 313 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF17P17021 662 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-GP17693 338 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CD22P20273 847 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 EPHA1P21709 976 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 VASNQ6EMK4 673 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CLN8Q9UBY8 286 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 YY2O15391 372 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 EPHA2P29317 976 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NUBP1P53384 320 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF117Q03924 483 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HYAL2Q12891 473 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SMUG1Q53HV7 270 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GLYATL3Q5SZD4 288 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 STUMQ69YW2 141 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RASL11AQ6T310 242 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RAB8BQ92930 207 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SFRP2Q96HF1 295 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 B4GALT2O60909 372 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GALR1P47211 349 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF77Q15935 545 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RAET1LQ5VY80 246 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 XAF1Q6GPH4 301 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms