RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 PSMB2P49721 201 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 RPS4Y2Q8TD47 263 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRB-202ENST00000334414 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 OR2A5Q96R48 311 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRB-202ENST00000334414 METAP1P53582 386 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 OR1L6Q8NGR2 347 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF799Q96GE5 643 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 GLIPR2Q9H4G4 154 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 SCN7AQ01118 1682 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 SPNP16150 400 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 CD82P27701 267 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 Q6ZSR9 355 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 FBXL6Q8N531 539 aa4.99□□□□□ -1.61
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