RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB25P24278 435 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OSTNP61366 133 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TNP2Q05952 138 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 MFAP5Q13361 173 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PPP1R1AQ13522 171 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 C4orf26Q17RF5 130 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 WDR82Q6UXN9 313 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PTX4Q96A99 478 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR51I1Q9H343 314 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 EVPLQ92817 2033 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 A8MXK9 166 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 F5H6K3 240 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 G3V4G9 280 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR7C2O60412 319 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 CBX7O95931 251 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 IGHV2-5P01817 119 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR5H8P0DN80 308 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ARSBP15848 533 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 HTR4Q13639 388 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 HIST3H3Q16695 136 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 BEST4Q8NFU0 473 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR4X1Q8NH49 305 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ARL11Q969Q4 196 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 IL17FQ96PD4 163 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 RNF122Q9H9V4 155 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 RFNGQ9Y644 331 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 V9GYS6 101 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 EFNA2O43921 213 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PIAS1O75925 651 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 HSD17B1P14061 328 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 AZU1P20160 251 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PRKACGP22612 351 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 MNDAP41218 407 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR3A2P47893 321 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 SGSHP51688 502 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 SELENOWP63302 87 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ARG2P78540 354 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 LY6KQ17RY6 165 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 CD276Q5ZPR3 534 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 STRADAQ7RTN6 431 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ASB13Q8WXK3 278 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 SMIM8Q96KF7 97 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 OR51J1Q9H342 316 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-202ENST00000327307 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms