RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 DAPP1Q9UN19 280 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RARRES2Q99969 163 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TUBA4BQ9H853 241 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FAM3AP98173 230 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TNFRSF9Q07011 255 aa14.86□□□□□ -0.03
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PACS1-201ENST00000320580 AQP10Q96PS8 301 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PP55 124 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FCARP24071 287 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ECI1P42126 302 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR10C1Q96KK4 312 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TECTBQ96PL2 329 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MFRPQ9BY79 579 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR5H8P0DN80 308 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MMP9P14780 707 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PSMB3P49720 205 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF92Q03936 586 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR5B2Q96R09 309 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ONECUT2O95948 504 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 METRNLQ641Q3 311 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR4N2Q8NGD1 307 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LHX4Q969G2 390 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SMIM8Q96KF7 97 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 KLF15Q9UIH9 416 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FUT9Q9Y231 359 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LRP12Q9Y561 859 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 GALR1P47211 349 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RTL6Q6ICC9 239 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TBX15Q96SF7 602 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 C1orf198Q9H425 327 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 R4GMQ9 66 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PLXNB2O15031 1838 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HSPB2A8KAH6 182 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 H3BML4 177 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CCKARP32238 428 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HSPB2Q16082 182 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR52N5Q8NH56 324 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TMEM234Q8WY98 164 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SDSLQ96GA7 329 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 REEP6Q96HR9 211 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CDC14CA4D256 554 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CD300LBA8K4G0 201 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 H0YGG7 62 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 H3BP45 60 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CD1AP06126 327 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SLC25A1P53007 311 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CARD18P57730 90 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FZD2Q14332 565 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ARRDC3Q96B67 414 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CSNK1A1P48729 337 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LHX9Q9NQ69 397 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 A0A087WUJ7 227 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GTI1 187 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 A8MVM7 634 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 GCGP01275 180 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HSD17B7P56937 341 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PHF19Q5T6S3 580 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HLA-CQ95604 372 aa14.83□□□□□ -0.03
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