RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MYCNOSP40205 109 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR4P46093 362 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DLX1P56177 255 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GMFBP60983 142 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CBX1P83916 185 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC34A1Q06495 639 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MEP1BQ16820 701 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DGUOKQ16854 277 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM219Q86XT9 240 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MKXQ8IYA7 352 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FGFRL1Q8N441 504 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf50Q8WW18 174 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GAFA1Q96PS6 74 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP57Q9NU63 452 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MRGBPQ9NV56 204 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DUX4Q9UBX2 424 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 B9D1Q9UPM9 204 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YHG0 523 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC12O95881 172 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC159P0C7I6 412 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF1BP20333 461 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD11B1P28845 292 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A6P31641 620 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC18A1P54219 525 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 BLCAPP62952 87 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOWP63302 87 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CSNK2BP67870 215 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35B1P78383 322 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SELPLGQ14242 412 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OTPQ5XKR4 325 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 HCP5Q6MZN7 132 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA40Q86UY6 237 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF561Q8N587 486 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PIFOQ8TCI5 191 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 STMN2Q93045 179 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RCHY1Q96PM5 261 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ15Q99712 375 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RGCCQ9H4X1 137 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM120BA0PK00 339 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB11A5LHX3 300 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 NPPAP01160 153 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RBP4P02753 201 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PGA5P0DJD9 388 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SELLP14151 372 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 KDELR2P33947 212 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 THBS3P49746 956 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB13P51153 203 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKXP51817 358 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FGD3Q5JSP0 725 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.31□□□□□ -1.4
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