RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 MRGPREQ86SM8 312 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 TMEM217Q8N7C4 229 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 RNF128Q8TEB7 428 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 HGDQ93099 445 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF285Q96NJ3 590 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 UCN2Q96RP3 112 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 SPIN2AQ99865 258 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 WNT11O96014 354 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 SMUG1Q53HV7 270 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 AADACL3Q5VUY0 350 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 RTL6Q6ICC9 239 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 TAAR9Q96RI9 348 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CA10Q9NS85 328 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 KCNE5Q9UJ90 142 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC187A0A096LP49 1063 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 OR4C45A6NMZ5 311 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 FOXC1Q12948 553 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CLINT1Q14677 625 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 S100PBPQ96BU1 408 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 OR5H15A6NDH6 313 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 BCL2L11O43521 198 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 GABRA1P14867 456 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 PDZK1IP1Q13113 114 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 OR51A4Q8NGJ6 313 aa17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CD300LBA8K4G0 201 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 HMSDA8MTL9 139 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 AQP8O94778 261 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 CNR1P21554 472 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 OR2B11Q5JQS5 317 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 EXD3Q8N9H8 876 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40-201ENST00000285243 MESTQ5EB52 335 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 AVPI1Q5T686 147 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PRSS35Q8N3Z0 413 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 OR2V1Q8NHB1 315 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TXNL1O43396 289 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 NRASP01111 189 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ALKBH6Q3KRA9 238 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TAF9BQ9HBM6 251 aa17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM208BQ5VWN6 2430 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 HAAOP46952 286 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 FOXB1Q99853 325 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ICAM5Q9UMF0 924 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CFDP00746 253 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CD80P33681 288 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ASB13Q8WXK3 278 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 REEP6Q96HR9 211 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PNLIPP16233 465 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 CSF2RBP32927 897 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 SCAND1P57086 179 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF774Q6NX45 483 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 SHISA5Q8N114 240 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP1R35Q8TAP8 253 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC17A5Q9NRA2 495 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 WDR1O75083 606 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 THY1P04216 161 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF728P0DKX0 622 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZFP82Q8N141 532 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 OR10D3Q8NH80 312 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 MCHR2Q969V1 340 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZFP64Q9NPA5 681 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 M0R296 226 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 DCTN6O00399 190 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PLPP3O14495 311 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 OR2Y1Q8NGV0 311 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 OR10Z1Q8NGY1 313 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TCFL5Q9UL49 500 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 TUSC2O75896 110 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP1R1AQ13522 171 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 NOXO1Q8NFA2 376 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 OR51A2Q8NGJ7 313 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 LHX6Q9UPM6 363 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms