RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ZNF416Q9BWM5 594 aa24.63■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 A0A0U1RQV5 110 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 TP53I11O14683 189 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 KCNAB3O43448 404 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 NAT2P11245 290 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CLDN17P56750 224 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 AADACL3Q5VUY0 350 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 TMPPEQ6ZT21 453 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ARL11Q969Q4 196 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PET100P0DJ07 73 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 MSR1P21757 451 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 STK11Q15831 433 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 RTL6Q6ICC9 239 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 WDR5BQ86VZ2 330 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 DEFB123Q8N688 67 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 GJC3Q8NFK1 279 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 AQP10Q96PS8 301 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SLC39A1Q9NY26 324 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 V9GYS6 101 aa24.62■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WZY1 265 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SERPINE3A8MV23 424 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SIGLEC5O15389 551 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CA11O75493 328 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SLC6A9P48067 706 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SNU13P55769 128 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 C10orf128Q5T292 105 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PP6455Q8WZ26 134 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 DUSP23Q9BVJ7 150 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 NELFAQ9H3P2 528 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ZNF160Q9HCG1 818 aa24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 FIGNL2A6NMB9 653 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ADAP1O75689 374 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PPA1Q15181 289 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 NKAPLQ5M9Q1 402 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PMS2CLQ68D20 193 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SVBPQ8N300 66 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CCDC54Q8NEL0 328 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 LYZL4Q96KX0 146 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 C2orf50Q96LR7 162 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 TM2D1Q9BX74 207 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 FAM74A7A6NL05 159 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 DHRS3O75911 302 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PLATP00750 562 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CSNK1A1P48729 337 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 H3F3AP84243 136 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD55Q3KP44 614 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 FAM74A3Q4VXF1 159 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 GUSBP11Q6P575 273 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CRIP3Q6Q6R5 217 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 SLC16A14Q7RTX9 510 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 DNAJB11Q9UBS4 358 aa24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 E9PLN8 166 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 TDGF1P13385 188 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 DRAM2Q6UX65 266 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZSR3 168 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PAQR8Q8TEZ7 354 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 C10orf35Q96D05 121 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PECRQ9BY49 303 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 EHFQ9NZC4 300 aa24.59■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PQM1 296 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 KLK2P20151 261 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 IL32P24001 234 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R3BQ86XI6 285 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ROBO4Q8WZ75 1007 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 TMEM54Q969K7 222 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 PI3P19957 117 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 ECI1P42126 302 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CCL7P80098 99 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 CHST5Q9GZS9 411 aa24.58■■□□□ 1.53
UBP1-201ENST00000283628 HPNP05981 417 aa24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 RPS2P15880 293 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 CPT2P23786 658 aa24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 LCN10Q6JVE6 187 aa24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 C1QL2Q7Z5L3 287 aa24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 POC1AQ8NBT0 407 aa24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 MMP26Q9NRE1 261 aa24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 OR5AC2Q9NZP5 309 aa24.57■■□□□ 1.52
UBP1-201ENST00000283628 PILRBQ9UKJ0 227 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 560.2 ms