RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	LDLRAD4	O15165	306 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TOX4	O94842	621 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FGF19	O95750	216 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBTB25	P24278	435 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB28	P51157	221 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC37A1	P57057	533 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZP2	Q05996	745 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FGF13	Q92913	245 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PRU2	124 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FGF16	O43320	207 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2J2	O76002	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ACKR1	Q16570	336 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PQY0	241 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	RAMP1	O60894	148 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	APOA2	P02652	100 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FCAR	P24071	287 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	IL12B	P29460	328 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	PADI1	Q9ULC6	663 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	CHRM2	P08172	466 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TBP	P20226	339 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	DUSP1	P28562	367 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC7A9	P82251	487 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NR0B2	Q15466	257 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895		Q8WTZ3	238 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	LHX4	Q969G2	390 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895		K7ERU9	68 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SSSCA1	O60232	199 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NPS	P0C0P6	89 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	WAS	P42768	502 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMB3	P49720	205 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	CLN3	Q13286	438 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FZD2	Q14332	565 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	SPACA7	Q96KW9	195 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	LPAR4	Q99677	370 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	CCL16	O15467	120 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	GP1BB	P13224	206 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR38	Q5JTN6	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	PRR27	Q6MZM9	219 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	GALNT14	Q96FL9	552 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TAAR9	Q96RI9	348 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	C8A	P07357	584 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	TNFSF10	P50591	281 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	NOG	Q13253	232 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SPIN3-231	ENST00000639895	YAF2	Q8IY57	180 aa		10.17	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms