RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586963.1

CAPNS1-203, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAPNS1, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TVP23AA6NH52 213 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF878C9JN71 531 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 NDUFB3O43676 98 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 KRT36O76013 467 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TSPAN15O95858 294 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 APOC1P02654 83 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC2A1P11166 492 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 PSKH1P11801 424 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 RRM2P31350 389 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 FMO3P31513 532 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC15A1P46059 708 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ENTPD1P49961 510 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 BLVRAP53004 296 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 FAM3AP98173 230 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ACSM1Q08AH1 577 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TAF13Q15543 124 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 WDR38Q5JTN6 314 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 WDR82Q6UXN9 313 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 WDR86Q86TI4 376 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LNX2Q8N448 690 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LINC00471Q8N535 108 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 Q8N7P7 452 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OR5R1Q8NH85 324 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LRRC29Q8WV35 223 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TNFRSF14Q92956 283 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SGK3Q96BR1 496 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ASB9Q96DX5 294 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LRGUKQ96M69 825 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TOR3AQ9H497 397 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 CENPMQ9NSP4 180 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 A0A1B0GW55 424 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 NPFFO15130 113 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 ATP5HO75947 161 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 SPARCP09486 303 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 AMY2BP19961 511 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 MAGEA2P43356 314 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 UBE2E1P51965 193 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC25A1P53007 311 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 CSNK2BP67870 215 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 CBX1P83916 185 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 SNCBQ16143 134 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 TIGD6Q17RP2 521 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 FBLN7Q53RD9 439 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 STUMQ69YW2 141 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 FGFRL1Q8N441 504 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF511Q8NB15 262 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 MED30Q96HR3 178 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 REEP6Q96HR9 211 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 MICU1Q9BPX6 476 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-203ENST00000586963 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.58□□□□□ -1.36
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