RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 MALLQ13021 153 aa25.25■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CLVS2Q5SYC1 327 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR10K2Q6IF99 312 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 MDP1Q86V88 176 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF101Q8IZC7 436 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM46BQ96A09 425 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP28Q9H239 520 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPTBN2O15020 2390 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC400499M0QZD8 3231 aa25.25■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PLA2G5P39877 138 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR3A4PP47883 348 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM189A2Q15884 450 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABRA6Q16445 453 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf185Q5T7R7 199 aa25.24■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RAD51DO75771 328 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UNC119Q13432 240 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF144BQ7Z419 303 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TECTBQ96PL2 329 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 OPA3Q9H6K4 179 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR173Q9NS66 373 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TNFSF13O75888 250 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCL2P13500 99 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC6A1P30531 599 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTL6Q6ICC9 239 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF554Q86TJ5 538 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM57AQ8TBR7 257 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF75AQ96N20 296 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 SULT1C2O00338 296 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 LYZL6O75951 148 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS3P35030 304 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KLK11Q9UBX7 282 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNN3Q9UGI6 736 aa25.21■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM215AQ9Y5M1 114 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa25.2■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXC12P31275 282 aa25.2■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D28Q2M2D7 210 aa25.2■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 S100A13Q99584 98 aa25.2■■□□□ 1.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NEURL2Q9BR09 285 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CST11Q9H112 138 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 DPAGT1Q9H3H5 408 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCPEP1Q9HB40 452 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 J3QW42 95 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRM2P08172 466 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTCP35070 178 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLA1AQ53H76 456 aa25.19■■□□□ 1.62
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