RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 OPN4Q9UHM6 478 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PRSS50Q9UI38 385 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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USP3-212ENST00000559276 A0A0D9SG52 128 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CIB4A0PJX0 185 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 J3QLW9 94 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SULT1C2O00338 296 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CDC42EP2O14613 210 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 TSPAN4O14817 238 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ARPC3O15145 178 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ADAM11O75078 769 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PTP4A3O75365 173 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SYNGR4O95473 234 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CH25HO95992 272 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 MT-ND4P03905 459 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ALDOBP05062 364 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 TACSTD2P09758 323 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ZNF19P17023 458 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PTNP21246 168 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 OR3A2P47893 321 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 VEGFCP49767 419 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SELENOPP49908 381 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CCR6P51684 374 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 MAP2K6P52564 334 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CAPZA1P52907 286 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CARD18P57730 90 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 OR10A3P58181 314 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PLAURQ03405 335 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 INSL4Q14641 139 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PGAP1Q75T13 922 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 FCRLAQ7L513 359 aa5.12□□□□□ -1.59
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USP3-212ENST00000559276 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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USP3-212ENST00000559276 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 FBXW5Q969U6 566 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 BCO1Q9HAY6 547 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 NOX3Q9HBY0 568 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 IFT46Q9NQC8 304 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 UPB1Q9UBR1 384 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 RCE1Q9Y256 329 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 V9GY05 133 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ANK2Q01484 3957 aa5.12□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CADP27708 2225 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 A0A0A6YYH2 397 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 A0A1W2PNR3 127 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 A6NJ64 397 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ACOD1A6NK06 481 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 FAM183AA6NL82 134 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 E9PI62 339 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 F5H5P2 479 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 H7C417 338 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 SCDO00767 359 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 CD5LO43866 347 aa5.11□□□□□ -1.59
USP3-212ENST00000559276 FCMRO60667 390 aa5.11□□□□□ -1.59
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