RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 ATF1P18846 271 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 SRMP19623 302 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 THBS2P35442 1172 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 GLRXP35754 106 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 KIR3DL2P43630 455 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 NCS1P62166 190 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 RSU1Q15404 277 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 MKXQ8IYA7 352 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 YIPF6Q96EC8 236 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf159Q96HA4 380 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 BOD1Q96IK1 185 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 SYT3Q9BQG1 590 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 TAS2R4Q9NYW5 299 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 FZR1Q9UM11 496 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 MPC1Q9Y5U8 109 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 A1L4Q6 167 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM64A6NGJ6 449 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 PNPP00491 289 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 IL1AP01583 271 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 CELA3BP08861 270 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 SCAND1P57086 179 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 FABP5Q01469 135 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 BSPH1Q075Z2 132 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 DOC2BQ14184 412 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 NAA40Q86UY6 237 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 TSC22D3Q99576 134 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 MRI1Q9BV20 369 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRO-210ENST00000544244 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 A6NIN4 97 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 GPX5O75715 221 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 LALBAP00709 142 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 NGFP01138 241 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 CRYGSP22914 178 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 RBP2P50120 134 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 FUT6P51993 359 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF92Q03936 586 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 GPR176Q14439 515 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 CARTPTQ16568 116 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 AGAP6Q5VW22 663 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF573Q86YE8 665 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 NEK7Q8TDX7 302 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 PIGTQ969N2 578 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 CST11Q9H112 138 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 METTL9Q9H1A3 318 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 PEX16Q9Y5Y5 336 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SMIM30A4D0T7 59 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC30A6NM36 301 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 NOTOA8MTQ0 251 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 TRAPPC2LH3BP13 241 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 M0R233 179 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SPRY3O43610 288 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SULT1B1O43704 296 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SMPD2O60906 423 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 GABARAPO95166 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ISG15P05161 165 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 GRPP07492 148 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 PRDX4Q13162 271 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SSX1Q16384 188 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 CEP78Q5JTW2 689 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SPANXN2Q5MJ10 180 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 AWAT2Q6E213 333 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 CHST4Q8NCG5 386 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 SPSB1Q96BD6 273 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRO-210ENST00000544244 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms