RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533644.5

BBS1-223, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-223	ENST00000533644	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ASRGL1	Q7L266	308 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	FTMT	Q8N4E7	242 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ITPKC	Q96DU7	683 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	LYZL4	Q96KX0	146 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	JMJD8	Q96S16	334 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	NUP50	Q9UKX7	468 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		14.73	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ACOD1	A6NK06	481 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	C3orf80	F5H4A9	247 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644		M0R129	80 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	NDUFA2	O43678	99 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	CST4	P01036	141 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	EGR1	P18146	543 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	FPR2	P25090	351 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	DCTD	P32321	178 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	GNAL	P38405	381 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	NPY4R	P50391	375 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	IL5RA	Q01344	420 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	KRT74	Q7RTS7	529 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	TMEM163	Q8TC26	289 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	UPRT	Q96BW1	309 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	OR8B4	Q96RC9	309 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ABCB9	Q9NP78	766 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	FAM206A	Q9NX38	181 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ZNF69	Q9UC07	566 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	COPS3	Q9UNS2	423 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644		A0A0U1RQV5	110 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	C22orf46	C9J442	243 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ZNF254	O75437	659 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	CIB2	O75838	187 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	CFHR2	P36980	270 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	CSNK2B	P67870	215 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	WDR82	Q6UXN9	313 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ITFG2	Q969R8	447 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	CIB1	Q99828	191 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	MICU1	Q9BPX6	476 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	MRO	Q9BYG7	248 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	ESM1	Q9NQ30	184 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-223	ENST00000533644	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	TRIM77	I1YAP6	450 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ADAM20	O43506	726 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	IGLV3-1	P01715	115 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	PRDX4	Q13162	271 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	DOK3	Q7L591	496 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	LRRC29	Q8WV35	223 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	MNT	Q99583	582 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	TMEM210	A6NLX4	147 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	PSMD9	O00233	223 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	FCN3	O75636	299 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	PLAT	P00750	562 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	GYPA	P02724	150 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
BBS1-223	ENST00000533644	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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