RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF121	Q9H920	327 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	NOX4	Q9NPH5	578 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	INIP	Q9NRY2	104 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	FZR1	Q9UM11	496 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	CLDN34	H7C241	214 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552		M0QX08	132 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	OR7A10	O76100	309 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	FSTL3	O95633	263 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	NPPA	P01160	153 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	IFNA14	P01570	189 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	OPN1SW	P03999	348 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	CST2	P09228	141 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	PATE4	P0C8F1	98 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	COX5B	P10606	129 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ACADS	P16219	412 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF32	P17041	273 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	WNT5A	P41221	380 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGDIA	P52565	204 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	CRYBA2	P53672	197 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	MTPN	P58546	118 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ERVS71-1	P61550	626 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	CTF1	Q16619	201 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	THEM4	Q5T1C6	240 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ST7L	Q8TDW4	575 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TAMM41	Q96BW9	452 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	HARBI1	Q96MB7	349 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	GPA33	Q99795	319 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC6A7	Q99884	636 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	SH3GL1	Q99961	368 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	NANOG	Q9H9S0	305 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	OPN4	Q9UHM6	478 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	C5orf49	A4QMS7	147 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552		A6NIZ1	184 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	AHCYL1	O43865	530 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC2A10	O95528	541 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV2-70	P01814	119 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	CCL2	P13500	99 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	FUT1	P19526	365 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	GSTM3	P21266	225 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	GZMM	P51124	257 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R41	P59536	307 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	RAP1B	P61224	184 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	RAP1A	P62834	184 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	AVPI1	Q5T686	147 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM239	Q8WW34	195 aa		5.65	□□□□□ -1.5

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