RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2F1Q13607 317 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ODF4Q2M2E3 257 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 GLMPQ8WWB7 406 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXW5Q969U6 566 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHL15Q96M94 604 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00052Q96N35 136 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 GBF1Q92538 1859 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 GGT3PA6NGU5 568 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM212A6NML5 194 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 LGALS8O00214 317 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 LANCL1O43813 399 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CTNSO60931 367 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 SCGNO76038 276 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFPL1O95159 310 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 FUT1P19526 365 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 TAS2R20P59543 309 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 DUSP8Q13202 625 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CDNFQ49AH0 187 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF626Q68DY1 528 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM166AQ6J272 317 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ACBD4Q8NC06 268 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ROBO4Q8WZ75 1007 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 WNT2BQ93097 391 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 MARC2Q969Z3 335 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 C10orf90Q96M02 699 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 NUDT9Q9BW91 350 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 JAM3Q9BX67 310 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CST11Q9H112 138 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR27Q9NS67 375 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CKAP5Q14008 2032 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A0A6YYD5 115 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1B0GW15 77 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PR48 441 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF860A6NHJ4 632 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 C17orf105B2RV13 164 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 HCRTR1O43613 425 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 DTYMKP23919 212 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CDK2P24941 298 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CSF2RBP32927 897 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 SELENOPP49908 381 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 TAS2R31P59538 309 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 AVPI1Q5T686 147 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 PFN4Q8NHR9 129 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM106AQ96A25 262 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 DERL3Q96Q80 235 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 OR52A5Q9H2C5 316 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 LIPGQ9Y5X9 500 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1B0GWA3 101 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 F8WDY8 70 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 H3BSH0 61 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 SULT1C2O00338 296 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 ST8SIA3O43173 380 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 FADS1O60427 444 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 FCMRO60667 390 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD28-213ENST00000498524 CEACAM4O75871 244 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms