RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SELLP14151 372 aa7.71□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNGR2P38484 337 aa7.71□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 CSNK2BP67870 215 aa7.71□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPAN31Q12999 210 aa7.71□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 MICBQ29980 383 aa7.71□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.71□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR82Q6UXN9 313 aa7.71□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.7□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.7□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 CENPMQ9NSP4 180 aa7.7□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 MEIOCA2RUB1 952 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF878C9JN71 531 aa7.69□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 TBX1O43435 398 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFB3O43676 98 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 PAHP00439 452 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 GYPBP06028 91 aa7.69□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP10-11P60412 298 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 GMFBP60983 142 aa7.69□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 CRMP1Q14194 572 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 TIGD6Q17RP2 521 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 CASC10Q5T4H9 136 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.69□□□□□ -1.18
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SMARCE1-210ENST00000481231 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5R1Q8NH85 324 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFRSF14Q92956 283 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 SGK3Q96BR1 496 aa7.69□□□□□ -1.18
SMARCE1-210ENST00000481231 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
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