RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478999.1

VPS45-208, Transcript of vacuolar protein sorting 45 homolog, human

TSL 2

Gene VPS45, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VPS45-208	ENST00000478999	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	GMDS	O60547	372 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR2A4	O95047	310 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	WNT11	O96014	354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ALDOB	P05062	364 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	UBB	P0CG47	229 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	HLA-DOB	P13765	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZNF43	P17038	809 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CCL1	P22362	96 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	P2RY4	P51582	365 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	GALK2	Q01415	458 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CAMK2D	Q13557	499 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ETFDH	Q16134	617 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	HIST3H3	Q16695	136 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZNF529	Q6P280	563 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	MDGA2	Q7Z553	956 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	LYPD6	Q86Y78	171 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR2M7	Q8NG81	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	POC1B	Q8TC44	478 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ORAI1	Q96D31	301 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	SGCZ	Q96LD1	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR2A7	Q96R45	310 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	FOXC2	Q99958	501 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	KLK11	Q9UBX7	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	VDAC3	Q9Y277	283 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZNF726	A6NNF4	738 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	C17orf51	A8MQB3	221 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	HMSD	A8MTL9	139 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999		H3BML4	177 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	SYT7	O43581	403 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	GPANK1	O95872	356 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CYB5A	P00167	134 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CD74	P04233	296 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CHRM2	P08172	466 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ACSM4	P0C7M7	580 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	GTF2F2	P13984	249 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	RAB3A	P20336	220 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CNR1	P21554	472 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	CHRNB4	P30926	498 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	MAGEB1	P43366	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	H3F3A	P84243	136 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	FMOD	Q06828	376 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ARL6IP1	Q15041	203 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999		Q5BKY6	102 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	C10orf128	Q5T292	105 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	FAM46B	Q96A09	425 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	C10orf35	Q96D05	121 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VPS45-208	ENST00000478999	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23

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