RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 C16orf89Q6UX73 402 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM57BQ71RH2 274 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00471Q8N535 108 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPERTQ8NA61 448 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2T33Q8NG76 320 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2T29Q8NH02 315 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFRSF14Q92956 283 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 LHX4Q969G2 390 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 REEP6Q96HR9 211 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 LYZL4Q96KX0 146 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL13Q99616 98 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPA3Q9H6K4 179 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.95□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GUS0 222 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR32B1ATL7 298 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBX1O43435 398 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP8B1O43520 1251 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR137BO60478 399 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SELENOFO60613 162 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLCEO94923 617 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRK5P34947 590 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 IER3P46695 156 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSK3AP49840 483 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLRD1Q13241 179 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDCD1Q15116 288 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNJ8Q15842 424 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF9Q16594 264 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZSV7 163 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4F5Q8NH21 305 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01006Q8NI28 216 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST8SIA4Q92187 359 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 INTS14Q96SY0 518 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOR3AQ9H497 397 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KPTNQ9Y664 436 aa6.94□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 B2RBV5 119 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCE2BO14633 110 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDIPTO14735 213 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLPXO76031 633 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KNG1P01042 644 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF3P17036 446 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC2A5P22732 501 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNGT1P63211 74 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF13Q15543 124 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGUOKQ16854 277 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIGD6Q17RP2 521 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDONQ4KMG0 1287 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 HCP5Q6MZN7 132 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRT74Q7RTS7 529 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNKDQ8N490 385 aa6.93□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms