RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383872.1

RNU6-841P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 841, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-841P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-841P-201ENST00000383872 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLC35B1P78383 322 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 DCDP81605 110 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SIGLEC14Q08ET2 396 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 NPRL3Q12980 569 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 NME3Q13232 169 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 NAB1Q13506 487 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 MESDQ14696 234 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 COG2Q14746 738 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TAF11Q15544 211 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLC15A2Q16348 729 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ALKBH6Q3KRA9 238 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SPATA45Q537H7 98 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ORMDL2Q53FV1 153 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 CYBRD1Q53TN4 286 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAM78BQ5VT40 261 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 HHATQ5VTY9 493 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLX4IPQ5VYV7 408 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SDE2Q6IQ49 451 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLC25A24Q6NUK1 477 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 CFAP161Q6P656 301 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 C1orf228Q6PIY5 440 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FBXW12Q6X9E4 464 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 HEATR4Q86WZ0 1026 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 DENND1CQ8IV53 801 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 DAND5Q8N907 189 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF738Q8NE65 137 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 NEK11Q8NG66 645 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 OR52K1Q8NGK4 314 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 NANPQ8TBE9 248 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ST8SIA4Q92187 359 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FGF13Q92913 245 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 RILPL2Q969X0 211 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAHD2AQ96GK7 314 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SMIM10Q96HG1 83 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ADTRPQ96IZ2 230 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 C4orf36Q96KX1 117 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 DEPDC7Q96QD5 511 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 OR4K3Q96R72 315 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ECSITQ9BQ95 431 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FERMT1Q9BQL6 677 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TMEM246Q9BRR3 403 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 INPP5KQ9BT40 448 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 DOHHQ9BU89 302 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLC25A2Q9BXI2 301 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 OSBPL8Q9BZF1 889 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TXNIPQ9H3M7 391 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FBXO44Q9H4M3 255 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 C14orf119Q9NWQ9 140 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLC39A1Q9NY26 324 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 EHFQ9NZC4 300 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TXNDC16Q9P2K2 825 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 CES1P1Q9UKY3 287 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PSMD13Q9UNM6 376 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PLA2G4CQ9UP65 541 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ASPMQ8IZT6 3477 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 AFF2P51816 1311 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 WASHC2AQ641Q2 1341 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 MYO3BQ8WXR4 1341 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 A0A0D9SEW6 157 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ARHGEF37A1IGU5 675 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PLEKHD1A6NEE1 506 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 LRRIQ4A6NIV6 560 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAM159BA6NKW6 160 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 YJEFN3A6XGL0 299 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 CLCA1A8K7I4 914 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 C2orf74A8MZ97 194 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 E7EVH7 732 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 C11orf98E9PRG8 122 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 I3L2K1 104 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 K7EPK0 472 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 M0R233 179 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 UPK1AO00322 258 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 XRCC3O43542 346 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 LANCL1O43813 399 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 NMT2O60551 498 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TBX10O75333 385 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 PIAS1O75925 651 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 ANXA9O76027 345 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLC22A5O76082 557 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 OR4F21O95013 312 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 OR5F1O95221 314 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-841P-201ENST00000383872 TRIM16O95361 564 aa-2.13□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms