RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 RNF170Q96K19 258 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-201ENST00000320857 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-201ENST00000320857 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-201ENST00000320857 ICMTO60725 284 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 TGM6O95932 706 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 VEGFCP49767 419 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 KISS1Q15726 138 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 AKAP13Q12802 2813 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 TMEM235A6NFC5 223 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CYB5AP00167 134 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 C1QBP02746 253 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 MELTFP08582 738 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 UBE2V2Q15819 145 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ST3GAL2Q16842 350 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CDNFQ49AH0 187 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 RNF144BQ7Z419 303 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 MED30Q96HR3 178 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CST11Q9H112 138 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 GP6Q9HCN6 339 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ZNF175Q9Y473 711 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 SSNA1O43805 119 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CDC14BO60729 498 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 RAB3DO95716 219 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 MPIG6BO95866 241 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CD3DP04234 171 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 IL5P05113 134 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 PTGFRP43088 359 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ALDH3B1P43353 468 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 HGFACQ04756 655 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 OR8S1Q8NH09 359 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 SPSB1Q96BD6 273 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 SLC22A20A6NK97 555 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 XRCC2O43543 280 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 FCGR2AP12318 317 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 FJX1Q86VR8 437 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CMBLQ96DG6 245 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 S100A13Q99584 98 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 GINS4Q9BRT9 223 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 BEX1Q9HBH7 125 aa14.81□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 COX5BP10606 129 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ANXA3P12429 323 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 PRKACBP22694 351 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 BEST4Q8NFU0 473 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ZNF222Q9UK12 451 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ING4Q9UNL4 249 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 WIPF3A6NGB9 483 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CEACAM4O75871 244 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 IGHG3P01860 377 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 CD74P04233 296 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 NAT2P11245 290 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 ARR3P36575 388 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 RAD52P43351 418 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 GZMKP49863 264 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-201ENST00000320857 PMP22Q01453 160 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms