RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM140Q9NV12 185 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 CTSFQ9UBX1 484 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 FCGR3AP08637 254 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 MAVSQ7Z434 540 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 WDTC1Q8N5D0 677 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51F2Q8NH61 342 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 DENND4CQ5VZ89 1909 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 CR2P20023 1033 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ERVS71-1P61550 626 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR31Q8NA23 367 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 TAAR6Q96RI8 345 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ACER3Q9NUN7 267 aa10.2□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SP1P08047 785 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 BAP18Q8IXM2 172 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM106AQ96A25 262 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 PAPLNO95428 1278 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 LIPIQ6XZB0 460 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OLIG1Q8TAK6 271 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 FOXC2Q99958 501 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 RREB1Q92766 1687 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC17A3O00476 420 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ALOX5APP20292 161 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 HIST1H4GQ99525 98 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 DPH7Q9BTV6 452 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 MELTFP08582 738 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 LIMS3P0CW19 117 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 LIMS4P0CW20 117 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5M1Q8NGP8 315 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 POM121L2Q96KW2 1035 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 C3orf30Q96M34 536 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 JAG1P78504 1218 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ASCL4Q6XD76 172 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 Q9N2K0 584 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 STRCQ7RTU9 1775 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 DHRS7CA6NNS2 312 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 HBQ1P09105 142 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 FHITP49789 147 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 PARM1Q6UWI2 310 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 PLPP6Q8IY26 295 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 CLDN34H7C241 214 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SELENOFO60613 162 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 BVESQ8NE79 360 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 FZD6O60353 706 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR32O75388 356 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS56P0CW18 603 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB38P57729 211 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 IGSF8Q969P0 613 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 RHOVQ96L33 236 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SELENBP1Q13228 472 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 DOC2AQ14183 400 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 GALNT16Q8N428 558 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OR1L1Q8NH94 360 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OR52D1Q9H346 318 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 MANBALQ9NQG1 85 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 KIR2DS4P43632 304 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 KIR2DS1Q14954 304 aa10.19□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 LEFTY2O00292 366 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 CSN3P07498 182 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 MPC1LP0DKB6 136 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 FRS3O43559 492 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 VEZF1Q14119 521 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00469Q8N7U9 141 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 ST8SIA5O15466 376 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 PTHLHP12272 177 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 DUSP21Q9H596 190 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2A5Q96R48 311 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 DDA1Q9BW61 102 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 RASL12Q9NYN1 266 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 IL4P05112 153 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 TCTN2Q96GX1 697 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.18□□□□□ -0.78
HDGFL3-201ENST00000299633 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms