RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 FGF21Q9NSA1 209 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 MEMO1Q9Y316 297 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ABCA4P78363 2273 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 GPR75O95800 540 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF735P0CB33 412 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 PET100P0DJ07 73 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 AMY2BP19961 511 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 EMP2P54851 167 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CCL7P80098 99 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 GAMTQ14353 236 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CDC6Q99741 560 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 PRO3102Q9H379 93 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 BANF2Q9H503 90 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 Q9N2J8 555 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 HHLA2Q9UM44 414 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 FRYQ5TBA9 3013 aa9.66□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ARPC3O15145 178 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 PIAS2O75928 621 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CCL4P13236 92 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ASCL1P50553 236 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 BTG2P78543 158 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 DPTQ07507 201 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 RHEBQ15382 184 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 FGGYQ96C11 551 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 OR10C1Q96KK4 312 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF878C9JN71 531 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 DUX1O43812 170 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 LMX1BO60663 402 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 SLC34A2O95436 690 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CD37P11049 281 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF823P16415 610 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 AGAP20933 346 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CXCR1P25024 350 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 CX3CR1P49238 355 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 SERINC2Q96SA4 455 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 DOK5Q9P104 306 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 FBXL17Q9UF56 701 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.65□□□□□ -0.86
CNGA3-201ENST00000272602 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CD1AP06126 327 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ACY1Q03154 408 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC17A1Q14916 467 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NSDHLQ15738 373 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DRAM2Q6UX65 266 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 LPAR4Q99677 370 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MENTQ9BUN1 341 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 LUZP4Q9P127 313 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.65□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 A0A087WUJ7 227 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF726A6NNF4 738 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HRKO00198 91 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 AK1P00568 194 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 GLRA1P23415 457 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NAAAQ02083 359 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CHAF1BQ13112 559 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NELFAQ9H3P2 528 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms