RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254976.6

SNAP25-201, Transcript of synaptosome associated protein 25, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAP25, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25-201ENST00000254976 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TRIQKQ629K1 86 aa11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 SPSB4Q96A44 273 aa11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 SP140LQ9H930 580 aa11.13□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 GMDSO60547 372 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 RFX2P48378 723 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 UNC119Q13432 240 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 OR8B8Q15620 311 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 KISS1Q15726 138 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 AWAT2Q6E213 333 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 PP6455Q8WZ26 134 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TRIM63Q969Q1 353 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 GPER1Q99527 375 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 A0A0G2JNJ9 132 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 A0A1W2PP11 408 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 VSIG8P0DPA2 414 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 PRF1P14222 555 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 BMP5P22003 454 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 SCAND1P57086 179 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TAS2R20P59543 309 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 DEFA1P59665 94 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 DEFA3P59666 94 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 UTS2BQ765I0 119 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 DPPA2Q7Z7J5 298 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 PIGCQ92535 297 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 YIPF5Q969M3 257 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ITFG2Q969R8 447 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 CCDC120Q96HB5 630 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 RGCCQ9H4X1 137 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 Q9UFV3 132 aa11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 MEIOCA2RUB1 952 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ALDOBP05062 364 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 CRHP06850 196 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 FAM157BP0CG42 384 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 NR4A2P43354 598 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 MMP15P51511 669 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 QRFPP83859 136 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 LY6DQ14210 128 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 BEND4Q6ZU67 534 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM104Q8NE00 496 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 C10orf35Q96D05 121 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 CYYR1Q96J86 154 aa11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 XRCC3O43542 346 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 LILRA1O75019 489 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 NRASP01111 189 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 IL32P24001 234 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ERVS71-1P61550 626 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 PITPNAQ00169 270 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ACBD4Q8NC06 268 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 BHLHE23Q8NDY6 225 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 OR52I2Q8NH67 350 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 BANF2Q9H503 90 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 PRORYQ9H606 182 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 GPR160Q9UJ42 338 aa11.1□□□□□ -0.63
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms