RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237380.11

MED28-201, Transcript of mediator complex subunit 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MED28, Length 10,868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28-201ENST00000237380 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 SBK2P0C263 348 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 SCAND1P57086 179 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 COX19Q49B96 90 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 SLC51BQ86UW2 128 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 ACER3Q9NUN7 267 aa6.7□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 OOEPA6NGQ2 149 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 ATF1P18846 271 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 PSENENQ9NZ42 101 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 G3V3Y1 287 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 CORTO00230 105 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 CDC20Q12834 499 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 SYS1Q8N2H4 156 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 NUBPLQ8TB37 319 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 GHSRQ92847 366 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 CCL26Q9Y258 94 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 AHRRA9YTQ3 701 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 H3F3AP84243 136 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 NFATC3Q12968 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 ADGRG7Q96K78 797 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 B4E171 279 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 DHHO43323 396 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 CCR9P51686 369 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 BTG2P78543 158 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 OR2F1Q13607 317 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 TESK1Q15569 626 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 CD200P41217 278 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 REC114Q7Z4M0 266 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 C10orf90Q96M02 699 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.69□□□□□ -1.34
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MED28-201ENST00000237380 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 F5H697 171 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 GFRA3O60609 400 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 PF4P02776 101 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 PFN3P60673 137 aa6.69□□□□□ -1.34
MED28-201ENST00000237380 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.69□□□□□ -1.34
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