RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	TFCP2	Q12800	502 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SCARB2-222	ENST00000640634	APBB1	O00213	710 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	SASH1	O94885	1247 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	CIAO1	O76071	339 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	PDE8B	O95263	885 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNJ4	P48050	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	SCN9A	Q15858	1988 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	RAD21	O60216	631 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ADORA1	P30542	326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	GYG1	P46976	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ECE2	O60344	883 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	FGFR2	P21802	821 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF609	O15014	1411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	RAD17	O75943	681 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	TIMM10	P62072	90 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	EYA3	Q99504	573 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	FZD9	O00144	591 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	YY1	P25490	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	BCAM	P50895	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SCARB2-222	ENST00000640634	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A1B0GUL7	405 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	HMMR	O75330	724 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	IGHD	P01880	384 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	CXCL9	Q07325	125 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	PHKA1	P46020	1223 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	LPIN2	Q92539	896 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634		G3V3G9	751 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	PSMD14	O00487	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC5A1	P13866	664 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms