RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	PRNP	P04156	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	WNT8B	Q93098	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L15	C9J2P7	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L10	C9JJH3	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L12	C9JPN9	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L11	C9JVI0	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L21	D6R901	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L18	D6R9N7	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L22	D6RA61	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L19	D6RCP7	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L20	D6RJB6	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	FOSL1	P15407	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	ITGB5	P18084	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	PTPRA	P18433	802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	PREP	P48147	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	ATP11A	P98196	1134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L24	Q0WX57	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	ADAM11	O75078	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	KIF4A	O95239	1232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	NEFL	P07196	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	EPHA1	P21709	976 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	CDC25B	P30305	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	SCNN1A	P37088	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	FLII	Q13045	1269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	COX20	Q5RI15	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	CABP4	P57796	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468		H3BRJ5	948 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	F13B	P05160	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	PDE4C	Q08493	712 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-204	ENST00000577468		A6NJR5	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	CEP120	Q8N960	986 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	GLMN	Q92990	594 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	RXRB	P28702	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	ARL4D	P49703	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	CYP26A1	O43174	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	NLRP12	P59046	1061 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-204	ENST00000577468	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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