RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ATP2B3Q16720 1220 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 METTL24Q5JXM2 366 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.42■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 ZAP70P43403 619 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 KLHL34Q8N239 644 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 APOBRQ0VD83 1088 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 UVSSAQ2YD98 709 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 WASHC4Q2M389 1173 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 DDX11Q96FC9 970 aa27.39■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 FOXP2O15409 715 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 RESTQ13127 1097 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 FUCA2Q9BTY2 467 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 PI16Q6UXB8 463 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 APPBP2Q92624 585 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.38■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 PDE8AO60658 829 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.37■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 CTDNEP1O95476 244 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 MCAMP43121 646 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 SPATA32Q96LK8 384 aa27.36■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 LRP5O75197 1615 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 H3BQV1 296 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 IFFO2Q5TF58 517 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 SLIT2O94813 1529 aa27.35■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 NRAPQ86VF7 1730 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 CHST3Q7LGC8 479 aa27.34■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.33■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 LIG1P18858 919 aa27.33■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
EHD4-202ENST00000569223 CCT2P78371 535 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 FBXL16Q8N461 479 aa27.33■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 FGAP02671 866 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.32■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 PDE8BO95263 885 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 HAND2P61296 217 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 SALL1Q9NSC2 1324 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 GPAA1O43292 621 aa27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 ATRNO75882 1429 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 ADD2P35612 726 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 NUP62CLQ9H1M0 184 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 KIF3AQ9Y496 699 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 RREB1Q92766 1687 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 EVCP57679 992 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 USP25Q9UHP3 1055 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 AK7Q96M32 723 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 PGBD1Q96JS3 809 aa27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms