RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	CSF1R	P07333	972 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	USP17L8	P0C7I0	530 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	HUNK	P57058	714 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	SCARF1	Q14162	830 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	COA1	Q9GZY4	146 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP2K2	P36507	400 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	CHRND	Q07001	517 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	MXD3	Q9BW11	206 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	PSME4	Q14997	1843 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	GRM8	O00222	908 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	FOXO4	P98177	505 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	OGFOD1	Q8N543	542 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	KLRK1	P26718	216 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	TAF5L	O75529	589 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	GML	Q99445	158 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF609	O15014	1411 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	DACT2	Q5SW24	774 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4C-208	ENST00000564966	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	CDCA5	Q96FF9	252 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	TSKS	Q9UJT2	592 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	PLIN1	O60240	522 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	GTF2I	P78347	998 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	RGMB	Q6NW40	437 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966		E9PSI1	815 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	NOG	Q13253	232 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	SNAP23	O00161	211 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-208	ENST00000564966	SASH1	O94885	1247 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	CD209	Q9NNX6	404 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC102A	Q96A19	550 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	CA12	O43570	354 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	ZIC5	Q96T25	663 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	WNT10B	O00744	389 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP4C-208	ENST00000564966	SLFN5	Q08AF3	891 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRC	P08575	1304 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	MMP14	P50281	582 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	JAG2	Q9Y219	1238 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	NF2	P35240	595 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	FKBP1B	P68106	108 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	DLGAP5	Q15398	846 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC10A3	P09131	477 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	IL1R1	P14778	569 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP4C-208	ENST00000564966	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31.88	■■■□□ 2.69

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