RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560576.1

TMOD2-204, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 2,348 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-204ENST00000560576 SOX10P56693 466 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 KSR2Q6VAB6 950 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 OGFOD1Q8N543 542 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 FBXW7Q969H0 707 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 STK31Q9BXU1 1019 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 COA1Q9GZY4 146 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 DACT2Q5SW24 774 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 MOB2Q70IA6 237 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 IGKV5-2P06315 115 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 GREM2Q9H772 168 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 WNT10BO00744 389 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 TBC1D8O95759 1140 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 TM4SF4P48230 202 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 SREBF2Q12772 1141 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 MXD3Q9BW11 206 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 SASH1O94885 1247 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 TSPYL6Q8N831 410 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 H7C1W4 665 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD2-204ENST00000560576 GPR25O00155 361 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 KCNJ4P48050 445 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 FKTNO75072 461 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 ITGA6P23229 1130 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 GTF2IP78347 998 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 PRKG1Q13976 671 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 ALDH1A1P00352 501 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 SLC4A2P04920 1241 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 GCKRQ14397 625 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 DLGAP5Q15398 846 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 G2E3Q7L622 706 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 OTOFQ9HC10 1997 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 CSF1RP07333 972 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 KLRK1P26718 216 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 CCDC27Q2M243 656 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 SPRYD7Q5W111 196 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 IL16Q14005 1332 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 INHBEP58166 350 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 CHRNDQ07001 517 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 LINS1Q8NG48 757 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 CD209Q9NNX6 404 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 CASP7P55210 303 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 FLIIQ13045 1269 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD2-204ENST00000560576 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms