RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560281.6

MEIS1-216, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MEIS1, Length 2,773 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-216ENST00000560281 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 CHADLQ6NUI6 762 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.96□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 NFIXQ14938 502 aa9.96□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.96□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.96□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
MEIS1-216ENST00000560281 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CNTNAP1P78357 1384 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SERPINB2P05120 415 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 PAX7P23759 505 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 ZNF445P59923 1031 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 KIF18AQ8NI77 898 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CNKSR1Q969H4 720 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 PASKQ96RG2 1323 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 ZSCAN26Q16670 478 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 POTECB2RU33 542 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 TRIM66O15016 1216 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 MCTP2Q6DN12 878 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SMIM5Q71RC9 77 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 NFKBIEO00221 500 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 STARD3NLO95772 234 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 NEFHP12036 1026 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 LDHDQ86WU2 507 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SCP2P22307 547 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CHRNA5P30532 468 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 MORC1Q86VD1 984 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CRBNQ96SW2 442 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CEP89Q96ST8 783 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SLC34A2O95436 690 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 E2F4Q16254 413 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 UVSSAQ2YD98 709 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CAND2O75155 1236 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 INHBEP58166 350 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 MYBPC2Q14324 1141 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 RASSF7Q02833 373 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 RABEP1Q15276 862 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 VPS33BQ9H267 617 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 BRD1O95696 1058 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 MASTLQ96GX5 879 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 RBSNQ9H1K0 784 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 RASSF10A6NK89 507 aa9.9□□□□□ -0.82
MEIS1-216ENST00000560281 TEX35Q5T0J7 233 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms