RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.45■■□□□ 1.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 COA1Q9GZY4 146 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 SNAP23O00161 211 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 RAD17O75943 681 aa23.44■■□□□ 1.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 CEP85Q6P2H3 762 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 PODNQ7Z5L7 613 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 SSH3Q8TE77 659 aa23.44■■□□□ 1.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.43■■□□□ 1.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF609O15014 1411 aa23.42■■□□□ 1.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.4■■□□□ 1.34
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RABGGTA-208ENST00000558954 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-208ENST00000558954 HACL1Q9UJ83 578 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-208ENST00000558954 POTECB2RU33 542 aa23.38■■□□□ 1.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 ATP2B3Q16720 1220 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-208ENST00000558954 CD209Q9NNX6 404 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L3A6NCW0 530 aa23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L4A6NCW7 530 aa23.37■■□□□ 1.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.37■■□□□ 1.33
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RABGGTA-208ENST00000558954 DACT2Q5SW24 774 aa23.32■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.32■■□□□ 1.32
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RABGGTA-208ENST00000558954 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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RABGGTA-208ENST00000558954 AAMPQ13685 434 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 LDHDQ86WU2 507 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR108Q9NPR9 543 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 TIMM10P62072 90 aa23.27■■□□□ 1.32
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