RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	TTC14	Q96N46	770 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	KRT85	P78386	507 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SIK1	P57059	783 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SCN7A	Q01118	1682 aa		10.02	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GUL7	405 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	MCM5	P33992	734 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	KAZALD1	Q96I82	304 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	RPS6KA4	O75676	772 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ZPR1	O75312	459 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2H	P62256	183 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ERICH2	A1L162	156 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	STX6	O43752	255 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TAF5L	O75529	589 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	A1BG	P04217	495 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	LDHC	P07864	332 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	CALM1	P0DP23	149 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	CALM2	P0DP24	149 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	CALM3	P0DP25	149 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PDE8B	O95263	885 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	SKAP1	Q86WV1	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	JMY	Q8N9B5	988 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ANXA1	P04083	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	XBP1	P17861	261 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ITGA6	P23229	1130 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	NGLY1	Q96IV0	654 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	BMP15	O95972	392 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	SIL1	Q9H173	461 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	BRAP	Q7Z569	592 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	NARF	Q9UHQ1	456 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667		H3BQV1	296 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PFKFB2	O60825	505 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	IFFO2	Q5TF58	517 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	SLC4A3	P48751	1232 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	F13A1	P00488	732 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PLCG2	P16885	1265 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	AK2	P54819	239 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	EVC	P57679	992 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF213	O14771	459 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	MYO1B	O43795	1136 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	NLRP3	Q96P20	1036 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TPM4	P67936	248 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM29	Q14134	588 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RBM23-233	ENST00000557667	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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