RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546279.5

LMO3-233, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 4

Gene LMO3, Length 590 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-233	ENST00000546279	EPHX2	P34913	555 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	CA12	O43570	354 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	MAP2K2	P36507	400 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	GPSM2	P81274	684 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.27	□□□□□ -0.28
LMO3-233	ENST00000546279	EYA2	O00167	538 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	CIAO1	O76071	339 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	GPC2	Q8N158	579 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	PSMD1	Q99460	953 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	SNAP23	O00161	211 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	SASH1	O94885	1247 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	CHRND	Q07001	517 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	AAMP	Q13685	434 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	FZD9	O00144	591 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	FGFR2	P21802	821 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	XDH	P47989	1333 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	KLRK1	P26718	216 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	MPND	Q8N594	471 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF609	O15014	1411 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	TAF5L	O75529	589 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	GRM1	Q13255	1194 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	SIL1	Q9H173	461 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	PDE8B	O95263	885 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	IGHD	P01880	384 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	TFCP2	Q12800	502 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LMO3-233	ENST00000546279	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29

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