RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	SLC5A1	P13866	664 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	LPIN2	Q92539	896 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	CXCL9	Q07325	125 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	SNAP23	O00161	211 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	RAD17	O75943	681 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	KLRK1	P26718	216 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	FGFR2	P21802	821 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	TFCP2	Q12800	502 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	IL1R1	P14778	569 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	SCN4A	P35499	1836 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	PSMD14	O00487	310 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	RRAGC	Q9HB90	399 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	PSME4	Q14997	1843 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF609	O15014	1411 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PUF60-222	ENST00000533362	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	GYG1	P46976	350 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	DPF2	Q92785	391 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362		A0A1B0GUL7	405 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	SASH1	O94885	1247 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	SCNN1D	P51172	638 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	MMP14	P50281	582 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	GTF2I	P78347	998 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	KIF3C	O14782	793 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	BCAM	P50895	628 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PUF60-222	ENST00000533362	POTEC	B2RU33	542 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362		H7C1D1	291 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	SEMA3E	O15041	775 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	EPHX2	P34913	555 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	TIMM10	P62072	90 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB22	O15209	634 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PUF60-222	ENST00000533362	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.61	■■■□□ 2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms