RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC4-211ENST00000492996 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 ERC2O15083 957 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 MYL6BP14649 208 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CHADLQ6NUI6 762 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 REC8O95072 547 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CASP7P55210 303 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 RABEP1Q15276 862 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 SSH3Q8TE77 659 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PLXNB2O15031 1838 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 H0YIN7 160 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 MAP2K2P36507 400 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TRAK2O60296 914 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 GMLQ99445 158 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 ZPR1O75312 459 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 HYPKQ9NX55 129 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CSF1RP07333 972 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 DDIT3P35638 169 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CHMLP26374 656 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 NEK4P51957 841 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 KSR2Q6VAB6 950 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 IL25Q9H293 177 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PALD1Q9ULE6 856 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 AK9Q5TCS8 1911 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 ST18O60284 1047 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 POLA2Q14181 598 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 SIL1Q9H173 461 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TCIRG1Q13488 830 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PKP1Q13835 747 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 USP16Q9Y5T5 823 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 COPS6Q7L5N1 327 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 RAB11FIP3O75154 756 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 GRAPQ13588 217 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TICAM2Q86XR7 235 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 GBP4Q96PP9 640 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 STAP2Q9UGK3 403 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 COL4A6Q14031 1691 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC4-211ENST00000492996 SUCLG2Q96I99 432 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 GRM8O00222 908 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 LINS1Q8NG48 757 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 MYD88Q99836 296 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 WBP1LQ9NX94 342 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JS52 829 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 ALDH1L1O75891 902 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC4-211ENST00000492996 MAP3K10Q02779 954 aa8.46□□□□□ -1.06
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