RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486851.5

ELL3-205, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 2

Gene ELL3, Length 667 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-205	ENST00000486851	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	CEP290	O15078	2479 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	SASH1	O94885	1247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	KLRK1	P26718	216 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	GJA5	P36382	358 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	CTSW	P56202	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	MYD88	Q99836	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	AOX1	Q06278	1338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-205	ENST00000486851	MMP14	P50281	582 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	GREM2	Q9H772	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	COL6A3	P12111	3177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	PTPN18	Q99952	460 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851		G3V3G9	751 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CASP7	P55210	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	INHBE	P58166	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	RALBP1	Q15311	655 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	NF2	P35240	595 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CRHR2	Q13324	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	PRKG1	Q13976	671 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-205	ENST00000486851		H7C1W4	665 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ELL3-205	ENST00000486851	SNAP23	O00161	211 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ELL3-205	ENST00000486851	CSF1R	P07333	972 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ELL3-205	ENST00000486851	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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