RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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NBPF3-212ENST00000486229 TFCP2Q12800 502 aa28.1■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 JDP2Q8WYK2 163 aa28.1■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.1■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.09■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.09■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.09■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.09■■■□□ 2.09
NBPF3-212ENST00000486229 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.08■■■□□ 2.09
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NBPF3-212ENST00000486229 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.08■■■□□ 2.09
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NBPF3-212ENST00000486229 COA1Q9GZY4 146 aa28.05■■■□□ 2.08
NBPF3-212ENST00000486229 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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NBPF3-212ENST00000486229 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.04■■■□□ 2.08
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NBPF3-212ENST00000486229 RNF181Q9P0P0 153 aa28.03■■■□□ 2.08
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NBPF3-212ENST00000486229 SLC51AQ86UW1 340 aa28.02■■■□□ 2.08
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NBPF3-212ENST00000486229 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-212ENST00000486229 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-212ENST00000486229 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
NBPF3-212ENST00000486229 ADORA1P30542 326 aa27.9■■■□□ 2.06
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