RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484147.5

PTPN22-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,258 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-205	ENST00000484147	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNK17	Q96T54	332 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PTPN22-205	ENST00000484147	MYO1C	O00159	1063 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	EGFR	P00533	1210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	OAT	P04181	439 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MYBL2	P10244	700 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147		A0A1B0GUL7	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TRIM66	O15016	1216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	C21orf2	O43822	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TRAF1	Q13077	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MARCH6	O60337	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CCP110	O43303	1012 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NLRP6	P59044	892 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	IFT88	Q13099	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	STK24	Q9Y6E0	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	APBB1	O00213	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	CHML	P26374	656 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PEX19	P40855	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GRIK3	Q13003	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SYCP1	Q15431	976 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PACS2	Q86VP3	889 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	RWDD2B	P57060	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	KIF4A	O95239	1232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	IMPDH2	P12268	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	ID4	P47928	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-205	ENST00000484147	PDIA5	Q14554	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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