RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471582.5

COL20A1-205, Transcript of collagen type XX alpha 1 chain, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene COL20A1, Length 1,924 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1-205ENST00000471582 ITGA6P23229 1130 aa22.1■■□□□ 1.13
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COL20A1-205ENST00000471582 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.08■■□□□ 1.13
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COL20A1-205ENST00000471582 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.08■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.08■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 LAMA4Q16363 1823 aa22.07■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 Q6ZUG5 572 aa22.07■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.06■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 BTAF1O14981 1849 aa22.05■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 ITPK1Q13572 414 aa22.05■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 MYH7P12883 1935 aa22.04■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.04■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.04■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.04■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
COL20A1-205ENST00000471582 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.02■■□□□ 1.12
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COL20A1-205ENST00000471582 PDE8BO95263 885 aa22.02■■□□□ 1.11
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COL20A1-205ENST00000471582 KRT85P78386 507 aa22.01■■□□□ 1.11
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COL20A1-205ENST00000471582 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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COL20A1-205ENST00000471582 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.01■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.01■■□□□ 1.11
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COL20A1-205ENST00000471582 MCAMP43121 646 aa22■■□□□ 1.11
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COL20A1-205ENST00000471582 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.98■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 RTL9Q8NET4 1388 aa21.98■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 ESPNB1AK53 854 aa21.98■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 DTNBO60941 627 aa21.98■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 CAMTA2O94983 1202 aa21.98■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.98■■□□□ 1.11
COL20A1-205ENST00000471582 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.98■■□□□ 1.11
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