RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464635.1

USP54-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 2

Gene USP54, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-209ENST00000464635 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.59□□□□□ -0.07
USP54-209ENST00000464635 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP54-209ENST00000464635 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP54-209ENST00000464635 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP54-209ENST00000464635 RTL9Q8NET4 1388 aa14.59□□□□□ -0.07
USP54-209ENST00000464635 PSMD14O00487 310 aa14.58□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 ECE2O60344 883 aa14.58□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 UFL1O94874 794 aa14.58□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 VEGFBP49765 207 aa14.58□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.58□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 BACH2Q9BYV9 841 aa14.58□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 TNIP1Q15025 636 aa14.57□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.57□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 SSH3Q8TE77 659 aa14.57□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 GREM2Q9H772 168 aa14.57□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.57□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 POLA2Q14181 598 aa14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 FAM161AQ3B820 660 aa14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 MICALL2Q8IY33 904 aa14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 EYA3Q99504 573 aa14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 RASSF10A6NK89 507 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 H7C1W4 665 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 GRM8O00222 908 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 RAB11FIP3O75154 756 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 EGFRP00533 1210 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 PDE4AP27815 886 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 GCKRQ14397 625 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 GGA1Q9UJY5 639 aa14.55□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 CASP7P55210 303 aa14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 CST9Q5W186 159 aa14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 XDHP47989 1333 aa14.54□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.53□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP54-209ENST00000464635 FOXN1O15353 648 aa14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 DLK2Q6UY11 383 aa14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 DPF2Q92785 391 aa14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 H7C1D1 291 aa14.51□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 RGS3P49796 1198 aa14.51□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.51□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.51□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ZNF609O15014 1411 aa14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ATP2B4P23634 1241 aa14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.5□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 MED23Q9ULK4 1368 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 G3V3G9 751 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ITGA6P23229 1130 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 KLRK1P26718 216 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 GRM1Q13255 1194 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 C8orf34Q49A92 452 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 USP48Q86UV5 1035 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 TNS4Q8IZW8 715 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 CAPNS2Q96L46 248 aa14.49□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 ADM5C9JUS6 153 aa14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 CSF1RP07333 972 aa14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 WBP1LQ9NX94 342 aa14.48□□□□□ -0.09
USP54-209ENST00000464635 AOX1Q06278 1338 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms