RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 ABL1P00519 1130 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 USTQ9Y2C2 406 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ALX3O95076 343 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPRAP18433 802 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC25BP30305 580 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ACPPP15309 386 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 CHRDQ9H2X0 955 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 EPHA1P21709 976 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 PMEPA1Q969W9 287 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAM19Q9H013 955 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 FZD6O60353 706 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 USP5P45974 858 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 FSCN2O14926 492 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 PHACTR2O75167 634 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFRSF21O75509 655 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 EHHADHQ08426 723 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ARID3AQ99856 593 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 NFKBIEO00221 500 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 EREGO14944 169 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 TRPA1O75762 1119 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 WISP1O95388 367 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 GLB1P16278 677 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 Q6ZS46 218 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 HHIPQ96QV1 700 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BRJ5 948 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 TM4SF5O14894 197 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 CABP4P57796 275 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 ACAD11Q709F0 780 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 GJD3Q8N144 294 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 EDN3P14138 238 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 PIP4K2BP78356 416 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC51AQ86UW1 340 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 WNT8BQ93098 351 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 OSMRQ99650 979 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BRB1 525 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 ICMTO60725 284 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 SERPINB4P48594 390 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 SOX13Q9UN79 622 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAM11O75078 769 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 NXPE3Q969Y0 559 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 CEP41Q9BYV8 373 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-204ENST00000461653 ARTNQ5T4W7 220 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 BSNDQ8WZ55 320 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 NLRP12P59046 1061 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 RETREG2Q8NC44 543 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 FSTP19883 344 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 ARL4DP49703 201 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 RAXQ9Y2V3 346 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.4 ms