RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 CES1P23141 567 aa7.15□□□□□ -1.26
TTC3-211ENST00000460328 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TTC3-211ENST00000460328 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.15□□□□□ -1.26
TTC3-211ENST00000460328 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.15□□□□□ -1.26
TTC3-211ENST00000460328 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 F8W735 103 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 NPR3P17342 541 aa7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 EPHA1P21709 976 aa7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 CHRDQ9H2X0 955 aa7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 FAM13AO94988 1023 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 PTPRAP18433 802 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 ARID3AQ99856 593 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 FAM177BA6PVY3 158 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 TRPA1O75762 1119 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 WISP1O95388 367 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 ARTNQ5T4W7 220 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 ADAM19Q9H013 955 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 USTQ9Y2C2 406 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 NFKBIEO00221 500 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 TM4SF5O14894 197 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 FSCN2O14926 492 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 EREGO14944 169 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 FZD6O60353 706 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 HHIPQ96QV1 700 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 H3BRJ5 948 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 PHACTR2O75167 634 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 TNFRSF21O75509 655 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 GLB1P16278 677 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 USP5P45974 858 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 Q6ZS46 218 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 ACAD11Q709F0 780 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 PMEPA1Q969W9 287 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 EHHADHQ08426 723 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC3-211ENST00000460328 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 ADAM11O75078 769 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 SERPINB4P48594 390 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 CABP4P57796 275 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 GJD3Q8N144 294 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 OSMRQ99650 979 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 SOX13Q9UN79 622 aa7.07□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 H3BRB1 525 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 ICMTO60725 284 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 EDN3P14138 238 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 PIP4K2BP78356 416 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 WNT8BQ93098 351 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 NXPE3Q969Y0 559 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.06□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 NLRP12P59046 1061 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 HGSNATQ68CP4 663 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 NBPF11Q86T75 865 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 LRP8Q14114 963 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 RETREG2Q8NC44 543 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 BSNDQ8WZ55 320 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 CEP41Q9BYV8 373 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC3-211ENST00000460328 FSTP19883 344 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms