RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 SIL1Q9H173 461 aa26.68■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 FBXO3Q9UK99 471 aa26.68■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 EPS15P42566 896 aa26.67■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.67■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1B0GUL6 1792 aa26.66■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 MTX1Q13505 466 aa26.66■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.66■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.66■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 USP17L3A6NCW0 530 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 USP17L4A6NCW7 530 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 PDE8BO95263 885 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 FSTL1Q12841 308 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 DPF2Q92785 391 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 FBXW7Q969H0 707 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 COPRSQ9NQ92 184 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 SCN9AQ15858 1988 aa26.64■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 H7C1D1 291 aa26.64■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 CIAO1O76071 339 aa26.64■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 CD209Q9NNX6 404 aa26.64■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 COG6Q9Y2V7 657 aa26.64■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 LDHDQ86WU2 507 aa26.63■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.63■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.63■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 PDE3AQ14432 1141 aa26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 CHADLQ6NUI6 762 aa26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.62■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 POTEIP0CG38 1075 aa26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 POTEJP0CG39 1038 aa26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 ATP8B2P98198 1209 aa26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 VPS37DQ86XT2 251 aa26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 MICALL2Q8IY33 904 aa26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.61■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.6■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.6■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.6■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.59■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 GYG1P46976 350 aa26.59■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 GTF2IP78347 998 aa26.59■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 SLC5A1P13866 664 aa26.58■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 IL1R1P14778 569 aa26.58■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ABCD4-202ENST00000460308 PSME4Q14997 1843 aa26.58■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 DACT2Q5SW24 774 aa26.57■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 LPIN2Q92539 896 aa26.57■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 SHTN1A0MZ66 631 aa26.56■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.56■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.56■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 USP17L8P0C7I0 530 aa26.55■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 HSPA6P17066 643 aa26.55■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 FGFR2P21802 821 aa26.55■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 POLA2Q14181 598 aa26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 ATP2B3Q16720 1220 aa26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 SSH3Q8TE77 659 aa26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 GMLQ99445 158 aa26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 MXD3Q9BW11 206 aa26.54■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 SASH1O94885 1247 aa26.53■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 OGFOD1Q8N543 542 aa26.53■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 BCAMP50895 628 aa26.52■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 CEP85Q6P2H3 762 aa26.52■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.52■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.52■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.52■■□□□ 1.84
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF609O15014 1411 aa26.51■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 TFCP2Q12800 502 aa26.51■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 CNTROBQ8N137 903 aa26.51■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 JAG2Q9Y219 1238 aa26.51■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.5■■□□□ 1.83
ABCD4-202ENST00000460308 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms