RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438777.5

CCDC18-AS1-211, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 752 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ST18O60284 1047 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZPR1O75312 459 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GYS1P13807 737 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TM4SF1P30408 202 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 EMP3P54852 163 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LHX6Q9UPM6 363 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 COL4A1P02462 1669 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MAP3K7O43318 606 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 APBA3O96018 575 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ITGA6P23229 1130 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RFC4P35249 363 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF827Q17R98 1081 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TNNI3KQ59H18 835 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC125Q86Z20 511 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SYNE4Q8N205 404 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SETDB2Q96T68 719 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GREM2Q9H772 168 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LTBP1Q14766 1721 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ERC2O15083 957 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CDC45O75419 566 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATP5JP18859 108 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SDSP20132 328 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FOSBP53539 338 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NFIXQ14938 502 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CRY2Q49AN0 593 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GPATCH3Q96I76 525 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SNRKQ9NRH2 765 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DOCK2Q92608 1830 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FGFR2P21802 821 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 OSBPP22059 807 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TFCP2Q12800 502 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ERFEQ4G0M1 354 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LRRC24Q50LG9 513 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 AACSQ86V21 672 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MARVELD3Q96A59 401 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IL17RAQ96F46 866 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ARXQ96QS3 562 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 APBB1O00213 710 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PDE8BO95263 885 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms