RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431095.5

H19-208, H19, imprinted maternally expressed transcript, human

TSL 5

Gene H19, Length 1,481 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
H19-208	ENST00000431095	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.95	■■■□□ 2.07
H19-208	ENST00000431095	SIL1	Q9H173	461 aa		27.95	■■■□□ 2.07
H19-208	ENST00000431095	RRAGC	Q9HB90	399 aa		27.95	■■■□□ 2.07
H19-208	ENST00000431095	POTEC	B2RU33	542 aa		27.95	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.95	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	RAD17	O75943	681 aa		27.94	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.94	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	KIF3C	O14782	793 aa		27.93	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.93	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.92	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.91	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.91	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	FGFR2	P21802	821 aa		27.9	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	PSMD14	O00487	310 aa		27.89	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.89	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.89	■■■□□ 2.06
H19-208	ENST00000431095	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	SCNN1D	P51172	638 aa		27.88	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	LPIN2	Q92539	896 aa		27.88	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	IL1R1	P14778	569 aa		27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.87	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	SCN4A	P35499	1836 aa		27.86	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.85	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	DPF2	Q92785	391 aa		27.85	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.85	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	SLC5A1	P13866	664 aa		27.84	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.84	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.84	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	GYG1	P46976	350 aa		27.83	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	TFCP2	Q12800	502 aa		27.83	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.83	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.83	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.83	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	ZNF609	O15014	1411 aa		27.83	■■■□□ 2.05
H19-208	ENST00000431095	HMMR	O75330	724 aa		27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	TOMM70	O94826	608 aa		27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	SASH1	O94885	1247 aa		27.82	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	EPHX2	P34913	555 aa		27.82	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	PSME4	Q14997	1843 aa		27.81	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	EPS15	P42566	896 aa		27.81	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.81	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.81	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	BCAM	P50895	628 aa		27.79	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	GTF2I	P78347	998 aa		27.79	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.79	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	GML	Q99445	158 aa		27.79	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.78	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.78	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	TIMM10	P62072	90 aa		27.77	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.77	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.77	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095		A0A1B0GUL7	405 aa		27.76	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095		H7C1D1	291 aa		27.76	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.76	■■■□□ 2.04
H19-208	ENST00000431095	AAMP	Q13685	434 aa		27.76	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.76	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.76	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	ZBTB22	O15209	634 aa		27.75	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.75	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	MMP14	P50281	582 aa		27.74	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.74	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.73	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.73	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.73	■■■□□ 2.03
H19-208	ENST00000431095	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.73	■■■□□ 2.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms