RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377689.2

FAM220BP-201, Transcript of family with sequence similarity 220 member B, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene FAM220BP, Length 816 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BP-201ENST00000377689 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 NIM1KQ8IY84 436 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 FZD9O00144 591 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 FGFR2P21802 821 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 RIMBP2O15034 1052 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 LPIN2Q92539 896 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 SNAP23O00161 211 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 SASH1O94885 1247 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 COA1Q9GZY4 146 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 GPR108Q9NPR9 543 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 WDR90Q96KV7 1748 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 SCN4AP35499 1836 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 ATP2B3Q16720 1220 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 PODNQ7Z5L7 613 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 G3V3G9 751 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 ECE2O60344 883 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 SLC5A1P13866 664 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 KLRK1P26718 216 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 TFCP2Q12800 502 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF609O15014 1411 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 GLTPD2A6NH11 291 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 YDJCA8MPS7 323 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 RAB11FIP3O75154 756 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 YY1P25490 414 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 DOK7Q18PE1 504 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 DCTPP1Q9H773 170 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 CD209Q9NNX6 404 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM220BP-201ENST00000377689 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 IL1R1P14778 569 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 CXCL9Q07325 125 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 TNIP1Q15025 636 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 GPC2Q8N158 579 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 A0A1B0GUL7 405 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 GYG1P46976 350 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 TNNI3KQ59H18 835 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 TIMM10P62072 90 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 VPS37DQ86XT2 251 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 USP17L3A6NCW0 530 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 USP17L4A6NCW7 530 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 RAD17O75943 681 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 XAGE2Q96GT9 111 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 PSMD14O00487 310 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 BCAMP50895 628 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 GCC1Q96CN9 775 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 SEMA3EO15041 775 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM220BP-201ENST00000377689 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM220BP-201ENST00000377689 ADORA1P30542 326 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM220BP-201ENST00000377689 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM220BP-201ENST00000377689 DACT2Q5SW24 774 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM220BP-201ENST00000377689 CCDC102BQ68D86 513 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM220BP-201ENST00000377689 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM220BP-201ENST00000377689 DPF2Q92785 391 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM220BP-201ENST00000377689 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.3 ms